MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 49637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	GA	3	6	39	44	50 %	0 %	50 %	0 %	332795694
2	NC_015518	A	6	6	73	78	100 %	0 %	0 %	0 %	332795694
3	NC_015518	AGA	2	6	130	135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795694
4	NC_015518	TAA	2	6	138	143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
5	NC_015518	A	6	6	175	180	100 %	0 %	0 %	0 %	332795694
6	NC_015518	TGT	2	6	235	240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795694
7	NC_015518	AT	4	8	244	251	50 %	50 %	0 %	0 %	332795694
8	NC_015518	AGA	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795694
9	NC_015518	A	7	7	271	277	100 %	0 %	0 %	0 %	332795694
10	NC_015518	GAGGAT	2	12	278	289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795694
11	NC_015518	CTC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795694
12	NC_015518	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	332795694
13	NC_015518	A	6	6	426	431	100 %	0 %	0 %	0 %	332795694
14	NC_015518	A	6	6	433	438	100 %	0 %	0 %	0 %	332795694
15	NC_015518	TTTA	2	8	465	472	25 %	75 %	0 %	0 %	332795694
16	NC_015518	AAG	2	6	496	501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795694
17	NC_015518	TAT	2	6	606	611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795694
18	NC_015518	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	332795694
19	NC_015518	AGC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795694
20	NC_015518	AGC	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795694
21	NC_015518	TAA	2	6	825	830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
22	NC_015518	TAGA	2	8	843	850	50 %	25 %	25 %	0 %	332795694
23	NC_015518	TTG	2	6	855	860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795694
24	NC_015518	AG	3	6	871	876	50 %	0 %	50 %	0 %	332795694
25	NC_015518	TTCCA	2	10	900	909	20 %	40 %	0 %	40 %	332795694
26	NC_015518	GTA	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795694
27	NC_015518	ATA	2	6	1031	1036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
28	NC_015518	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
29	NC_015518	AAAGAT	2	12	1063	1074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795694
30	NC_015518	TAAA	2	8	1077	1084	75 %	25 %	0 %	0 %	332795694
31	NC_015518	AGG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332795694
32	NC_015518	TA	3	6	1109	1114	50 %	50 %	0 %	0 %	332795694
33	NC_015518	GAA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
34	NC_015518	AAAG	2	8	1272	1279	75 %	0 %	25 %	0 %	332795695
35	NC_015518	AGA	3	9	1289	1297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
36	NC_015518	A	7	7	1332	1338	100 %	0 %	0 %	0 %	332795695
37	NC_015518	TAT	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795695
38	NC_015518	AGGA	2	8	1375	1382	50 %	0 %	50 %	0 %	332795695
39	NC_015518	GAA	2	6	1416	1421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
40	NC_015518	CAG	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795695
41	NC_015518	AGAA	2	8	1455	1462	75 %	0 %	25 %	0 %	332795695
42	NC_015518	GA	3	6	1475	1480	50 %	0 %	50 %	0 %	332795695
43	NC_015518	AGA	2	6	1498	1503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
44	NC_015518	TG	3	6	1544	1549	0 %	50 %	50 %	0 %	332795696
45	NC_015518	ATCT	2	8	1558	1565	25 %	50 %	0 %	25 %	332795696
46	NC_015518	CAT	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795696
47	NC_015518	GTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795696
48	NC_015518	TAT	2	6	1635	1640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795696
49	NC_015518	AT	4	8	1642	1649	50 %	50 %	0 %	0 %	332795696
50	NC_015518	GAT	3	9	1659	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795696
51	NC_015518	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795696
52	NC_015518	T	6	6	1781	1786	0 %	100 %	0 %	0 %	332795696
53	NC_015518	CTCA	2	8	1898	1905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015518	ATT	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795697
55	NC_015518	TTCTCC	2	12	1981	1992	0 %	50 %	0 %	50 %	332795697
56	NC_015518	CCTTTA	2	12	2046	2057	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332795697
57	NC_015518	TTC	2	6	2086	2091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
58	NC_015518	AATTC	2	10	2106	2115	40 %	40 %	0 %	20 %	332795697
59	NC_015518	TCT	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
60	NC_015518	TA	4	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	332795697
61	NC_015518	ATT	2	6	2210	2215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795697
62	NC_015518	CTC	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795697
63	NC_015518	AAT	2	6	2346	2351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795697
64	NC_015518	ATCTC	2	10	2363	2372	20 %	40 %	0 %	40 %	332795697
65	NC_015518	TA	3	6	2416	2421	50 %	50 %	0 %	0 %	332795697
66	NC_015518	TCT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
67	NC_015518	T	6	6	2454	2459	0 %	100 %	0 %	0 %	332795697
68	NC_015518	GTC	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795697
69	NC_015518	TCT	2	6	2495	2500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
70	NC_015518	TTA	2	6	2517	2522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795697
71	NC_015518	AAACCT	2	12	2621	2632	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332795697
72	NC_015518	ATG	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795697
73	NC_015518	ACT	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795698
74	NC_015518	CTA	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795698
75	NC_015518	TCT	2	6	2863	2868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795698
76	NC_015518	AAGG	2	8	2893	2900	50 %	0 %	50 %	0 %	332795698
77	NC_015518	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795698
78	NC_015518	GAT	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795698
79	NC_015518	ATT	2	6	2995	3000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795698
80	NC_015518	T	6	6	3005	3010	0 %	100 %	0 %	0 %	332795699
81	NC_015518	CTC	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795699
82	NC_015518	AT	3	6	3111	3116	50 %	50 %	0 %	0 %	332795699
83	NC_015518	CTT	2	6	3120	3125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795699
84	NC_015518	TAT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795699
85	NC_015518	A	6	6	3210	3215	100 %	0 %	0 %	0 %	332795699
86	NC_015518	TAT	2	6	3259	3264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795699
87	NC_015518	TAT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015518	AAT	2	6	3374	3379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015518	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795700
90	NC_015518	TAC	3	9	3411	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795700
91	NC_015518	ATTC	2	8	3449	3456	25 %	50 %	0 %	25 %	332795700
92	NC_015518	T	6	6	3497	3502	0 %	100 %	0 %	0 %	332795700
93	NC_015518	ACA	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795700
94	NC_015518	TATC	2	8	3578	3585	25 %	50 %	0 %	25 %	332795700
95	NC_015518	T	6	6	3596	3601	0 %	100 %	0 %	0 %	332795700
96	NC_015518	TC	3	6	3617	3622	0 %	50 %	0 %	50 %	332795700
97	NC_015518	AAAT	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	332795700
98	NC_015518	ATA	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795700
99	NC_015518	AAT	2	6	3758	3763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795700
100	NC_015518	AGG	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332795700
101	NC_015518	GAAGT	2	10	4005	4014	40 %	20 %	40 %	0 %	332795700
102	NC_015518	GAA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795700
103	NC_015518	CAA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795700
104	NC_015518	CTT	2	6	4077	4082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795700
105	NC_015518	AAG	2	6	4296	4301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795700
106	NC_015518	TCT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795700
107	NC_015518	TA	4	8	4419	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	332795700
108	NC_015518	ATT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795700
109	NC_015518	TTC	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795700
110	NC_015518	ATC	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795700
111	NC_015518	ACT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795700
112	NC_015518	AT	3	6	4633	4638	50 %	50 %	0 %	0 %	332795700
113	NC_015518	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015518	TAA	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795701
115	NC_015518	ATA	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795701
116	NC_015518	AGT	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795701
117	NC_015518	TCC	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795701
118	NC_015518	GTA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795701
119	NC_015518	TAT	2	6	4990	4995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795701
120	NC_015518	CTG	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795701
121	NC_015518	TAAG	2	8	5114	5121	50 %	25 %	25 %	0 %	332795701
122	NC_015518	A	6	6	5137	5142	100 %	0 %	0 %	0 %	332795701
123	NC_015518	CTG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795701
124	NC_015518	TAT	2	6	5231	5236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795701
125	NC_015518	AGGC	2	8	5305	5312	25 %	0 %	50 %	25 %	332795701
126	NC_015518	CAG	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795701
127	NC_015518	AGG	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332795701
128	NC_015518	TAA	2	6	5417	5422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795701
129	NC_015518	CAG	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795701
130	NC_015518	TGC	2	6	5475	5480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795701
131	NC_015518	ACA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795701
132	NC_015518	AAATAA	2	12	5512	5523	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795701
133	NC_015518	TTC	2	6	5562	5567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015518	TCAT	2	8	5689	5696	25 %	50 %	0 %	25 %	332795702
135	NC_015518	CCAT	2	8	5723	5730	25 %	25 %	0 %	50 %	332795702
136	NC_015518	CTTT	2	8	5759	5766	0 %	75 %	0 %	25 %	332795702
137	NC_015518	ATA	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795702
138	NC_015518	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795702
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404	NC_015518	T	6	6	16419	16424	0 %	100 %	0 %	0 %	332795711
405	NC_015518	AAT	2	6	16489	16494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795711
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433	NC_015518	AT	3	6	17796	17801	50 %	50 %	0 %	0 %	332795713
434	NC_015518	ATTT	2	8	17803	17810	25 %	75 %	0 %	0 %	332795713
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481	NC_015518	GAA	2	6	19543	19548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795714
482	NC_015518	TGA	2	6	19701	19706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795714
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495	NC_015518	AT	3	6	20281	20286	50 %	50 %	0 %	0 %	332795715
496	NC_015518	TAT	3	9	20299	20307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795715
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498	NC_015518	TAT	2	6	20377	20382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795715
499	NC_015518	TCG	2	6	20436	20441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795715
500	NC_015518	TTA	2	6	20442	20447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795715

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